新疆大果沙棘含有17种氨基酸，氨基酸具有促进人体生长发育、改善睡眠、提高记忆力、降血脂、抗溃疡、防止动脉硬化的作用，对维护神经系统的正常活动十分有利；蛋白质是人体必需的六大营养素之一。高含量的氨基酸和蛋白质是沙棘的另一大优势。

包括7种必需氨基酸，2种半必需氨基酸，8种非必需氨基酸（不一定非从食物直接摄取不可，自身合成或由其它氨基酸转化）。沙棘蛋白质中氨基酸种类丰富，含有人体必需的8种氨基酸，其中酪氨酸（18.3%）和谷氨酸（16.8%）含量最高。

沙棘蛋白中氨基酸总量为83.41%，其中必需氨基酸总量为67.57%，接近完全蛋白。沙棘蛋白在叶、果肉、种子中均有分布，其中种子的蛋白质含量最多，为24.4%左右，沙棘叶中的蛋白质含量可达10%~25%，沙棘果肉中的蛋白质含量为2.89%。

其中8种为人体不能合成的必需氨基酸（人体不能合成或合成速度远不适应机体的需要，必需由食物蛋白供给）：赖氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、苏氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸。

1、赖氨酸（Lysine）：促进大脑发育，是肝及胆的组成成分，能促进脂肪代谢，调节松果腺、乳腺、黄体及卵巢，防止细胞退化。

2、色氨酸（Tryptophane）：促进胃液及胰液的产生；细胞退化

3、苯丙氨酸（Phenylalanine）：参与消除肾及膀胱功能的损耗；

4、蛋氨酸（又叫甲硫氨酸）（Methionine）；参与组成血红蛋白、组织与血清，有促进脾脏、胰脏及淋巴的功能

5、苏氨酸（Threonine）：有转变某些氨基酸达到平衡的功能；

6、异亮氨酸（Isoleucine）：参与胸腺、脾脏及脑下腺的调节以及代谢；脑下腺属总司令部作用于甲状腺、性腺；

7、亮氨酸（Leucine）：作用平衡异亮氨酸；

8、缬氨酸（Valine）：作用于黄体、乳腺及卵巢。